DESENVOLVIMENTO DE UM BANCO DE DADOS DE FATOR DE TRANSCRIÇÃO HUMANO

Osvaldo Cesar Pinheiro Almeida, Luiz Augusto Bovolenta, Marcio Luis Acencio, Ney Lemke

Resumo


Há uma dificuldade no acesso às informações sobre fatores de transcrição humanos, pois estas se encontram dispersas na literatura biomédica. A centralização destas informações em bancos de dados facilita o acesso às informações sobre os fatores de transcrição. Atualmente, existem dois principais bancos de dados responsáveis pelo armazenamento dessas informações: TRANSFAC e TRED. Este trabalho tem como objetivo o desenvolvimento de uma nova base de dados para o armazenamento de informações relacionadas aos fatores de transcrição, aproveitando as vantagens dos dois principais bancos de dados existentes e suprindo as suas necessidades e desvantagens. A base de dados gerada concentra informações sobre os fatores de transcrição humanos, incluindo os seus respectivos genes regulados, bem como as referências contendo as provas experimentais da regulação dos genes por esses fatores de transcrição. Para armazenar as informações sobre fatores de transcrição, foi utilizado o Sistema de Gerenciamento de Banco de Dados (SGBD) PostgreSQL. Foi implementada uma interface web, usando linguagem de programação Java e a tecnologia Servlet e JSP, para acessar as informações do banco de dados. O desenvolvimento deste trabalho resultou em uma base de dados gratuita sobre fatores de transcrição humanos. O sistema web para acessar estas informações é de fácil utilização e, por isso, possibilita a ampla disseminação das informações contidas nesta base.

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